Desde a sua criação, em 1998, o Centro de Documentação tem vindo a assumir um papel importante, não só na vida da Associação como na comunidade estudantil portuguesa.
Este Centro de Documentação é parte integrante do Centro LGBT e é coordenado por uma equipa de voluntári@s e profissionais. Nele estão à disposição um vasto acervo de livros, revistas, trabalhos de investigação, vídeos, recortes de jornais, etc., de temática LGBT.
A consulta da documentação deste Centro é livre e gratuita, sendo actualmente muito procurado por estudantes e investigadores universitários que realizam pesquisas e trabalhos académicos.
É indiscutível a importância do Centro de Documentação na investigação académica de portugueses e de estrangeiros, dado oferecer um fundo documental de temática homossexual, constituído por recortes de imprensa, desde 1998 até à actualidade, trabalhos de investigação na área, várias publicações periódicas, alguma literatura e ainda ensaios. De acordo com um levantamento feito nos dois últimos anos, o espólio existente no Centro de Documentação Gonçalo Diniz é único.
Os voluntários deste Centro organizam Feiras do Livro com êxito considerável, tendo contado na última edição com 120 títulos de 23 editoras.